Como vuestro paisano, nativo de Wadowice, y al mismo tiempo servidor de la Iglesia universal en la sede de San Pedro en Roma, os deseo que en esta nueva iglesia resuene siempre la declaración de Pedro: "Tú eres el Cristo, el Hijo del Dios vivo". Deseo que estas palabras resuenen aquí de generación en generación, siempre con el mismo poder salvador, como han resonado durante dos milenios. Juan Pablo II
"Habemus Papam" - las palabras pronunciadas por el cardenal Pericle Felici el 16 de octubre de 1978 anunciaron un gran cambio en la Iglesia Católica. El nuevo Papa Juan Pablo II se convirtió en el primer jefe de la Iglesia Católica fuera de Italia en 455 años y, además, "de un país lejano", como él mismo dijo en ese momento.
Poco después de este evento, en Wadowice surgió la idea de construir una nueva iglesia como un voto de agradecimiento y conmemoración de este momento importante en la historia. Durante su primera visita a la ciudad natal en 1979, se acordó que la nueva iglesia estaría en la calle Zegadłowicza (hoy Avenida de Nuestra Señora de Fátima).
El atentado contra la vida de Juan Pablo II el 13 de mayo de 1981 contribuyó a ampliar las intenciones votivas. El nuevo templo dedicado a San Pedro Apóstol sería, a partir de entonces, un voto de agradecimiento por la elección y la salvación del Santo Padre. El diseño arquitectónico y urbanístico fue confiado al equipo dirigido por el profesor Tadeusz Szafer (1920-2017) de Cracovia. La construcción del templo tuvo lugar entre 1984 y 1991 y fue realizada con el esfuerzo de los habitantes de Wadowice. Los feligreses no solo donaron para el nuevo templo, sino que también participaron personalmente en los trabajos de construcción. El esfuerzo organizativo corrió a cargo del padre Michał Piosek (1944-1993), antiguo vicario de la parroquia de la Presentación de la Bienaventurada Virgen María, más tarde párroco de la nueva parroquia. El padre se dedicó por completo a este trabajo, con toda su energía, fuerza y salud. Fue el alma de todas las actividades, animando y movilizando a los feligreses en su esfuerzo y generosidad, superando barreras burocráticas, consiguiendo materiales de construcción (nada fácil en aquella época), supervisando las obras, etc. En 1985, fue con una peregrinación de feligreses a Roma y, el 29 de mayo, en una audiencia con el Santo Padre, recibió la bendición para la nueva parroquia y el templo en construcción.
La solemne consagración tuvo lugar el 14 de agosto de 1991, durante la segunda visita de Juan Pablo II en Wadowice. En la plaza frente a la iglesia, el Santo Padre celebró una misa solemne. En la procesión de la Ofrenda participaron delegaciones de diversos sectores de Wadowice: constructores de la iglesia, maestros, profesionales de la salud, artesanos, así como delegaciones de mineros y montañeses. En ese momento, el Papa coronó la figura de Nuestra Señora de Fátima, que regaló a la nueva parroquia el obispo de Fátima.
El conjunto sacro de San Pedro Apóstol, consagrado por Juan Pablo II, simboliza su viaje desde Wadowice, pasando por la catedral en Wawel hasta la Sede de Pedro. Consta de una iglesia, una capilla de Cristo Rey, una casa catequética con la rectoría y una torre independiente.
